Скажите пожалуйста, может ли клебсиелла быть угрозой для плода при беременности?

Если ее очень много, то да, т.к. с ней в компании будут и другие потенциальные возбудители, а бактерий- защитников, следовательно, почти не останется. Соответственно, произойдут негативные изменение не только по иммунитету, но и по всем другим процессам (обменным, нервной деятельности и пр.).